במושב יש אזור מסחרי אשר כולל מחסנים ורוב אנשי המושב עובדים בעבודות עצמאיות. בשנת 2000, מושב בית נקופה יצא עם פרוייקט בנייה חדש של שכונה קהילתית, בחלק מהבתים גרים הבנים של המתיישבים הוותיקים וחלק נמכרו למשפחות מחוץ למושב.
הניהול של המושב מתקיים על ידי המזכירות המופעלות על ידי וועד האגודה וכן וועד מקומי נבחרים.
כ- 700 דונם של אדמות המושב מעובדים על ידי אגודת פלחה משותפת למושבי מטה יהודה.
לאחרונה המושב שתל ומחזיק ב- 500 דונם עצי זית מזן סורי.
המושב במו"מ להקמת מספר מיזמים בנושאים של תיירות וכו'...
המושב משקיע תקציבים מיוחדים בנושאים של נוער וקהילה ומסייע רבות בנושא דת.